Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms