Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rpl39lQ9CQD0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rpl39lQ9CQD0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rpl39lQ9CQD0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rpl39lQ9CQD0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rpl39lQ9CQD0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rpl39lQ9CQD0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rpl39lQ9CQD0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rpl39lQ9CQD0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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