Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chchd1Q9CQA6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd1Q9CQA6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1099.3 ms