Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Trappc5Q9CQA1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Trappc5Q9CQA1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Trappc5Q9CQA1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc5Q9CQA1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Trappc5Q9CQA1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Trappc5Q9CQA1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Trappc5Q9CQA1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Trappc5Q9CQA1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Trappc5Q9CQA1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Trappc5Q9CQA1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc5Q9CQA1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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