Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp2Q9CQ73 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp2Q9CQ73 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp2Q9CQ73 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp2Q9CQ73 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms