Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp3Q9CQ10 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms