Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11bQ99PV8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11bQ99PV8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11bQ99PV8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bcl11bQ99PV8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Bcl11bQ99PV8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Bcl11bQ99PV8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Bcl11bQ99PV8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Bcl11bQ99PV8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms