Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem2Q99NH8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem2Q99NH8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem2Q99NH8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms