Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4dQ99N05 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4dQ99N05 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms