Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SncaipQ99ME3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms