Protein–RNA interactions for Protein: Q99LW6

Yaf2, YY1-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yaf2Q99LW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Yaf2Q99LW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yaf2Q99LW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yaf2Q99LW6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms