Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms