Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cstf3Q99LI7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cstf3Q99LI7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cstf3Q99LI7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms