Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms