Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms