Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ciao1Q99KN2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ciao1Q99KN2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ciao1Q99KN2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.2 ms