Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp11Q99K46 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp11Q99K46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp11Q99K46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms