Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lims1Q99JW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lims1Q99JW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lims1Q99JW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms