Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ddb2Q99J79 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ddb2Q99J79 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Ddb2Q99J79 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Ddb2Q99J79 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Ddb2Q99J79 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddb2Q99J79 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Ddb2Q99J79 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ddb2Q99J79 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddb2Q99J79 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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