Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfxn4Q925N1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfxn4Q925N1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms