Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Lmo1Q924W9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Lmo1Q924W9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Lmo1Q924W9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Lmo1Q924W9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmo1Q924W9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Lmo1Q924W9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmo1Q924W9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Lmo1Q924W9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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