Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ripply3Q924S9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ripply3Q924S9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms