Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf3Q920N1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms