Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6cQ91ZQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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