Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trpm2Q91YD4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Trpm2Q91YD4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Trpm2Q91YD4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms