Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb12Q91Y07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb12Q91Y07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb12Q91Y07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms