Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco4Q91WU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco4Q91WU4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms