Protein–RNA interactions for Protein: Q91WQ9

Calml4, Calmodulin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml4Q91WQ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calml4Q91WQ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calml4Q91WQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calml4Q91WQ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms