Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klc3Q91W40 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klc3Q91W40 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Klc3Q91W40 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klc3Q91W40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klc3Q91W40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Klc3Q91W40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klc3Q91W40 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klc3Q91W40 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms