Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp3Q91W36 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp3Q91W36 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms