Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd3Q91W18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tdrd3Q91W18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd3Q91W18 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms