Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dcaf11Q91VU6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcaf11Q91VU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms