Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrnp25Q8VIK1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp25Q8VIK1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp25Q8VIK1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrnp25Q8VIK1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrnp25Q8VIK1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp25Q8VIK1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp25Q8VIK1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp25Q8VIK1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp25Q8VIK1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms