Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf4Q8VI88 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf4Q8VI88 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms