Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc39cQ8VE09 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc39cQ8VE09 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc39cQ8VE09 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39cQ8VE09 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Ttc39cQ8VE09 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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