Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx7Q8VDS3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx7Q8VDS3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms