Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1Q8VDF2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1Q8VDF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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