Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fyco1Q8VDC1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fyco1Q8VDC1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fyco1Q8VDC1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms