Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc18Q8VD24 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zcchc18Q8VD24 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc18Q8VD24 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms