Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh10Q8VCH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh10Q8VCH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh10Q8VCH7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms