Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4X3

Rbm12, RNA-binding protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm12Q8R4X3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm12Q8R4X3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm12Q8R4X3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm12Q8R4X3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms