Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tut1Q8R3F9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tut1Q8R3F9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tut1Q8R3F9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tut1Q8R3F9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tut1Q8R3F9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tut1Q8R3F9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms