Protein–RNA interactions for Protein: Q8K596

Slc8a2, Sodium/calcium exchanger 2, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a2Q8K596 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a2Q8K596 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a2Q8K596 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a2Q8K596 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a2Q8K596 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc8a2Q8K596 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc8a2Q8K596 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a2Q8K596 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms