Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufs8Q8K3J1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms