Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MyripQ8K3I4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MyripQ8K3I4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms