Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncapd2Q8K2Z4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncapd2Q8K2Z4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms