Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf39Q8K2Z2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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