Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paf1Q8K2T8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paf1Q8K2T8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms