Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud6bQ8K2H2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud6bQ8K2H2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms