Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S3

Unc5b, Netrin receptor UNC5B, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5bQ8K1S3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Unc5bQ8K1S3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Unc5bQ8K1S3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Unc5bQ8K1S3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms